Ekstra kurikuler MTQ MI Maarif Mangunsari merupakan ektra wajib bagi seluruh siswa siswi madrasah yang termasuk bagian dari program TPQ PAgi dan TPQ Sore. Pembina MTQ diambil dari Seluruh Guru Madrasah sendiri. Dengan mengikuti kegiatan seperti ini dapat bermanfaat bagi anak-anak dan menumbuhkan rasa cintanya terhadap Al-Qur’an. Banyak prestasi yang diberikan anak anak kepada Madrasah